R/contact_countries.R
contact_df_countries.RdGet a data.frame (in long format) of contact data for multiple countries
contact_df_countries(countries, ...)A character string or a vector of character containing the names of the countries for which to return contact data
Arguments passed to contact_matrix()
A data.frame (in long format) with 4 columns:
country: the country name
age_from: the age group of individual
age_to: the age group of contact
contact: the intensity of contact
Kiesha Prem, Alex R. Cook, Mark Jit, Projecting social contact matrices in 152 countries using contact surveys and demographic data, PLoS Comp. Biol. (2017), doi:10.1371/journal.pcbi.1005697
Kiesha Prem, Kevin van Zandvoort, Petra Klepac, Rosalind M. Eggo, Nicholas G. Davies, CMMID COVID-19 Working Group, Alex R. Cook, Mark Jit, Projecting contact matrices in 177 geographical regions: An update and comparison with empirical data for the COVID-19 era, PLoS Comp. Biol. (2021), doi:10.1371/journal.pcbi.1009098 .
contact_df_countries(c("Austria", "Belgium"), location = "all")
#> country age_from age_to contact
#> 1 Austria [00,05) [00,05) 2.57832
#> 2 Austria [05,10) [00,05) 1.21139
#> 3 Austria [10,15) [00,05) 0.35961
#> 4 Austria [15,20) [00,05) 0.28192
#> 5 Austria [20,25) [00,05) 0.33834
#> 6 Austria [25,30) [00,05) 0.65584
#> 7 Austria [30,35) [00,05) 0.78240
#> 8 Austria [35,40) [00,05) 0.72109
#> 9 Austria [40,45) [00,05) 0.48626
#> 10 Austria [45,50) [00,05) 0.31847
#> 11 Austria [50,55) [00,05) 0.27336
#> 12 Austria [55,60) [00,05) 0.34435
#> 13 Austria [60,65) [00,05) 0.32839
#> 14 Austria [65,70) [00,05) 0.26060
#> 15 Austria [70,75) [00,05) 0.19196
#> 16 Austria [75,80) [00,05) 0.25425
#> 17 Austria [00,05) [05,10) 0.92094
#> 18 Austria [05,10) [05,10) 5.54205
#> 19 Austria [10,15) [05,10) 1.92530
#> 20 Austria [15,20) [05,10) 0.44065
#> 21 Austria [20,25) [05,10) 0.33149
#> 22 Austria [25,30) [05,10) 0.39638
#> 23 Austria [30,35) [05,10) 0.75155
#> 24 Austria [35,40) [05,10) 0.93742
#> 25 Austria [40,45) [05,10) 0.66768
#> 26 Austria [45,50) [05,10) 0.36811
#> 27 Austria [50,55) [05,10) 0.30513
#> 28 Austria [55,60) [05,10) 0.34792
#> 29 Austria [60,65) [05,10) 0.29175
#> 30 Austria [65,70) [05,10) 0.29123
#> 31 Austria [70,75) [05,10) 0.26336
#> 32 Austria [75,80) [05,10) 0.24141
#> 33 Austria [00,05) [10,15) 0.47330
#> 34 Austria [05,10) [10,15) 1.04480
#> 35 Austria [10,15) [10,15) 8.65137
#> 36 Austria [15,20) [10,15) 2.90195
#> 37 Austria [20,25) [10,15) 0.38014
#> 38 Austria [25,30) [10,15) 0.31214
#> 39 Austria [30,35) [10,15) 0.54276
#> 40 Austria [35,40) [10,15) 0.71856
#> 41 Austria [40,45) [10,15) 0.91165
#> 42 Austria [45,50) [10,15) 0.59656
#> 43 Austria [50,55) [10,15) 0.51753
#> 44 Austria [55,60) [10,15) 0.44696
#> 45 Austria [60,65) [10,15) 0.28614
#> 46 Austria [65,70) [10,15) 0.25578
#> 47 Austria [70,75) [10,15) 0.29514
#> 48 Austria [75,80) [10,15) 0.28626
#> 49 Austria [00,05) [15,20) 0.36082
#> 50 Austria [05,10) [15,20) 0.40085
#> 51 Austria [10,15) [15,20) 0.92765
#> 52 Austria [15,20) [15,20) 9.12983
#> 53 Austria [20,25) [15,20) 1.86793
#> 54 Austria [25,30) [15,20) 0.71920
#> 55 Austria [30,35) [15,20) 0.43897
#> 56 Austria [35,40) [15,20) 0.68920
#> 57 Austria [40,45) [15,20) 0.80602
#> 58 Austria [45,50) [15,20) 1.00036
#> 59 Austria [50,55) [15,20) 0.77494
#> 60 Austria [55,60) [15,20) 0.49052
#> 61 Austria [60,65) [15,20) 0.32093
#> 62 Austria [65,70) [15,20) 0.24999
#> 63 Austria [70,75) [15,20) 0.38040
#> 64 Austria [75,80) [15,20) 0.28610
#> 65 Austria [00,05) [20,25) 0.49986
#> 66 Austria [05,10) [20,25) 0.33672
#> 67 Austria [10,15) [20,25) 0.44340
#> 68 Austria [15,20) [20,25) 1.16607
#> 69 Austria [20,25) [20,25) 3.36886
#> 70 Austria [25,30) [20,25) 1.66501
#> 71 Austria [30,35) [20,25) 0.92077
#> 72 Austria [35,40) [20,25) 0.72108
#> 73 Austria [40,45) [20,25) 0.86495
#> 74 Austria [45,50) [20,25) 0.90108
#> 75 Austria [50,55) [20,25) 1.00680
#> 76 Austria [55,60) [20,25) 0.70345
#> 77 Austria [60,65) [20,25) 0.47466
#> 78 Austria [65,70) [20,25) 0.36032
#> 79 Austria [70,75) [20,25) 0.30593
#> 80 Austria [75,80) [20,25) 0.26106
#> 81 Austria [00,05) [25,30) 0.88350
#> 82 Austria [05,10) [25,30) 0.70215
#> 83 Austria [10,15) [25,30) 0.51938
#> 84 Austria [15,20) [25,30) 0.70140
#> 85 Austria [20,25) [25,30) 1.46198
#> 86 Austria [25,30) [25,30) 3.02566
#> 87 Austria [30,35) [25,30) 1.55400
#> 88 Austria [35,40) [25,30) 1.25972
#> 89 Austria [40,45) [25,30) 1.11388
#> 90 Austria [45,50) [25,30) 0.98343
#> 91 Austria [50,55) [25,30) 1.30587
#> 92 Austria [55,60) [25,30) 1.13902
#> 93 Austria [60,65) [25,30) 0.75194
#> 94 Austria [65,70) [25,30) 0.53820
#> 95 Austria [70,75) [25,30) 0.44956
#> 96 Austria [75,80) [25,30) 0.30864
#> 97 Austria [00,05) [30,35) 1.19903
#> 98 Austria [05,10) [30,35) 1.03313
#> 99 Austria [10,15) [30,35) 0.65650
#> 100 Austria [15,20) [30,35) 0.57586
#> 101 Austria [20,25) [30,35) 0.91134
#> 102 Austria [25,30) [30,35) 1.59066
#> 103 Austria [30,35) [30,35) 2.49274
#> 104 Austria [35,40) [30,35) 1.55811
#> 105 Austria [40,45) [30,35) 1.41692
#> 106 Austria [45,50) [30,35) 1.15213
#> 107 Austria [50,55) [30,35) 1.12041
#> 108 Austria [55,60) [30,35) 1.18836
#> 109 Austria [60,65) [30,35) 0.82714
#> 110 Austria [65,70) [30,35) 0.71016
#> 111 Austria [70,75) [30,35) 0.47634
#> 112 Austria [75,80) [30,35) 0.46043
#> 113 Austria [00,05) [35,40) 1.08644
#> 114 Austria [05,10) [35,40) 1.19617
#> 115 Austria [10,15) [35,40) 1.03175
#> 116 Austria [15,20) [35,40) 0.85259
#> 117 Austria [20,25) [35,40) 0.75262
#> 118 Austria [25,30) [35,40) 1.18200
#> 119 Austria [30,35) [35,40) 1.58806
#> 120 Austria [35,40) [35,40) 2.61579
#> 121 Austria [40,45) [35,40) 1.62128
#> 122 Austria [45,50) [35,40) 1.31220
#> 123 Austria [50,55) [35,40) 1.09831
#> 124 Austria [55,60) [35,40) 0.96128
#> 125 Austria [60,65) [35,40) 0.86923
#> 126 Austria [65,70) [35,40) 0.69605
#> 127 Austria [70,75) [35,40) 0.69387
#> 128 Austria [75,80) [35,40) 0.46534
#> 129 Austria [00,05) [40,45) 0.64976
#> 130 Austria [05,10) [40,45) 1.01740
#> 131 Austria [10,15) [40,45) 1.21721
#> 132 Austria [15,20) [40,45) 0.98825
#> 133 Austria [20,25) [40,45) 0.71323
#> 134 Austria [25,30) [40,45) 0.96930
#> 135 Austria [30,35) [40,45) 1.14880
#> 136 Austria [35,40) [40,45) 1.69460
#> 137 Austria [40,45) [40,45) 2.36411
#> 138 Austria [45,50) [40,45) 1.40519
#> 139 Austria [50,55) [40,45) 1.38226
#> 140 Austria [55,60) [40,45) 1.01831
#> 141 Austria [60,65) [40,45) 0.74004
#> 142 Austria [65,70) [40,45) 0.67864
#> 143 Austria [70,75) [40,45) 0.75598
#> 144 Austria [75,80) [40,45) 0.50439
#> 145 Austria [00,05) [45,50) 0.47854
#> 146 Austria [05,10) [45,50) 0.58568
#> 147 Austria [10,15) [45,50) 0.82655
#> 148 Austria [15,20) [45,50) 1.08290
#> 149 Austria [20,25) [45,50) 1.01194
#> 150 Austria [25,30) [45,50) 0.90950
#> 151 Austria [30,35) [45,50) 0.96049
#> 152 Austria [35,40) [45,50) 1.17883
#> 153 Austria [40,45) [45,50) 1.47086
#> 154 Austria [45,50) [45,50) 2.02146
#> 155 Austria [50,55) [45,50) 1.60351
#> 156 Austria [55,60) [45,50) 0.92374
#> 157 Austria [60,65) [45,50) 0.66507
#> 158 Austria [65,70) [45,50) 0.51954
#> 159 Austria [70,75) [45,50) 0.66419
#> 160 Austria [75,80) [45,50) 0.63777
#> 161 Austria [00,05) [50,55) 0.54661
#> 162 Austria [05,10) [50,55) 0.49701
#> 163 Austria [10,15) [50,55) 0.57475
#> 164 Austria [15,20) [50,55) 0.70464
#> 165 Austria [20,25) [50,55) 0.79999
#> 166 Austria [25,30) [50,55) 1.04626
#> 167 Austria [30,35) [50,55) 0.90129
#> 168 Austria [35,40) [50,55) 0.96816
#> 169 Austria [40,45) [50,55) 1.12059
#> 170 Austria [45,50) [50,55) 1.25765
#> 171 Austria [50,55) [50,55) 1.94412
#> 172 Austria [55,60) [50,55) 1.31226
#> 173 Austria [60,65) [50,55) 0.73133
#> 174 Austria [65,70) [50,55) 0.60889
#> 175 Austria [70,75) [50,55) 0.59034
#> 176 Austria [75,80) [50,55) 0.71759
#> 177 Austria [00,05) [55,60) 0.50700
#> 178 Austria [05,10) [55,60) 0.44970
#> 179 Austria [10,15) [55,60) 0.39081
#> 180 Austria [15,20) [55,60) 0.41256
#> 181 Austria [20,25) [55,60) 0.53849
#> 182 Austria [25,30) [55,60) 0.68474
#> 183 Austria [30,35) [55,60) 0.77166
#> 184 Austria [35,40) [55,60) 0.68418
#> 185 Austria [40,45) [55,60) 0.57535
#> 186 Austria [45,50) [55,60) 0.71731
#> 187 Austria [50,55) [55,60) 1.12574
#> 188 Austria [55,60) [55,60) 1.72105
#> 189 Austria [60,65) [55,60) 0.99125
#> 190 Austria [65,70) [55,60) 0.72362
#> 191 Austria [70,75) [55,60) 0.56122
#> 192 Austria [75,80) [55,60) 0.51528
#> 193 Austria [00,05) [60,65) 0.37891
#> 194 Austria [05,10) [60,65) 0.39709
#> 195 Austria [10,15) [60,65) 0.29193
#> 196 Austria [15,20) [60,65) 0.27856
#> 197 Austria [20,25) [60,65) 0.30529
#> 198 Austria [25,30) [60,65) 0.43668
#> 199 Austria [30,35) [60,65) 0.51623
#> 200 Austria [35,40) [60,65) 0.56191
#> 201 Austria [40,45) [60,65) 0.51916
#> 202 Austria [45,50) [60,65) 0.45797
#> 203 Austria [50,55) [60,65) 0.60430
#> 204 Austria [55,60) [60,65) 0.84998
#> 205 Austria [60,65) [60,65) 1.36237
#> 206 Austria [65,70) [60,65) 0.78041
#> 207 Austria [70,75) [60,65) 0.92781
#> 208 Austria [75,80) [60,65) 0.42903
#> 209 Austria [00,05) [65,70) 0.29396
#> 210 Austria [05,10) [65,70) 0.28752
#> 211 Austria [10,15) [65,70) 0.25984
#> 212 Austria [15,20) [65,70) 0.21992
#> 213 Austria [20,25) [65,70) 0.21528
#> 214 Austria [25,30) [65,70) 0.27370
#> 215 Austria [30,35) [65,70) 0.31787
#> 216 Austria [35,40) [65,70) 0.38756
#> 217 Austria [40,45) [65,70) 0.36825
#> 218 Austria [45,50) [65,70) 0.32556
#> 219 Austria [50,55) [65,70) 0.32570
#> 220 Austria [55,60) [65,70) 0.43104
#> 221 Austria [60,65) [65,70) 0.61346
#> 222 Austria [65,70) [65,70) 1.07650
#> 223 Austria [70,75) [65,70) 0.81967
#> 224 Austria [75,80) [65,70) 0.52299
#> 225 Austria [00,05) [70,75) 0.23180
#> 226 Austria [05,10) [70,75) 0.21371
#> 227 Austria [10,15) [70,75) 0.23088
#> 228 Austria [15,20) [70,75) 0.18086
#> 229 Austria [20,25) [70,75) 0.22974
#> 230 Austria [25,30) [70,75) 0.21038
#> 231 Austria [30,35) [70,75) 0.21729
#> 232 Austria [35,40) [70,75) 0.30339
#> 233 Austria [40,45) [70,75) 0.30044
#> 234 Austria [45,50) [70,75) 0.29919
#> 235 Austria [50,55) [70,75) 0.30021
#> 236 Austria [55,60) [70,75) 0.28777
#> 237 Austria [60,65) [70,75) 0.43779
#> 238 Austria [65,70) [70,75) 0.45180
#> 239 Austria [70,75) [70,75) 1.15714
#> 240 Austria [75,80) [70,75) 0.54054
#> 241 Austria [00,05) [75,80) 0.19012
#> 242 Austria [05,10) [75,80) 0.18893
#> 243 Austria [10,15) [75,80) 0.20996
#> 244 Austria [15,20) [75,80) 0.16357
#> 245 Austria [20,25) [75,80) 0.20098
#> 246 Austria [25,30) [75,80) 0.16880
#> 247 Austria [30,35) [75,80) 0.21169
#> 248 Austria [35,40) [75,80) 0.21532
#> 249 Austria [40,45) [75,80) 0.25187
#> 250 Austria [45,50) [75,80) 0.27342
#> 251 Austria [50,55) [75,80) 0.28435
#> 252 Austria [55,60) [75,80) 0.25519
#> 253 Austria [60,65) [75,80) 0.28647
#> 254 Austria [65,70) [75,80) 0.30960
#> 255 Austria [70,75) [75,80) 0.46497
#> 256 Austria [75,80) [75,80) 0.55061
#> 257 Belgium [00,05) [00,05) 4.55145
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